Ұзақ уақыт бойы ниндзя тасбақалар адамдардан қорғану үшін қалалық канализацияда жасырынады. Ұстаз Сплинтер бірнеше жыл бойы тасбақаларға жекпе-жек өнерін үйретіп, әділдік сезімін оятты. Бір кездері олар Нью-Йорктегі билікті басып алған Фут кланының жетекшісі Шреддерден Нью-Йоркті құтқару үшін жоғары көтерілуге ​​мәжбүр болады. Эйприл және Верн атты батыл жауынгерлер жеңіске жетіп, сүйікті қаласын қылмыстан тазартады. Леонардо, Микеланджело, Рафаэль және Донателло өмірдегі негізгі міндетін анықтап, өз қаласының қорғаушысына айналады. Олар Нью-Йоркке тәртіп енгізіп, еркін түрде демалысқа шыға алушы еді, бірақ бір күні олар қайтадан өз қаласына қауіп төндіретін күшті жауға тап болады.